Kolonoskopi öncesi hazırlık, kalın bağırsağın temizlenmesi ve işlemin sağlıklı şekilde yapılabilmesi için önemlidir. İşlemden önce doktorun önerdiği beslenme düzenine uyulmalı, genellikle berrak sıvı diyeti uygulanmalı ve reçete edilen bağırsak temizleyici ilaç kullanılmalıdır. Kan sulandırıcı veya diyabet ilacı kullanan hastalar doktorlarını bilgilendirmelidir. Hazırlık talimatlarına doğru uyulması, bağırsakların daha iyi görüntülenmesini ve doğru tanı konulmasını sağlar.