Endoskopiden korkan kişiler için kapsül endoskopi bir seçenek olabilir. Küçük bir kamera içeren kapsül yutularak sindirim sistemi görüntülenir ve genellikle anestezi gerekmez. Ancak her hastalıkta klasik endoskopinin yerini tutmaz; uygun yöntem doktor tarafından belirlenir.